En las últimas décadas, se ha constituido un sistema extenso y diverso de áreas protegidas en la Amazonía brasileña. Paralelamente a esta geopolítica de la conservación, los gobiernos federal y estatal han implementado un conjunto de estrategias y políticas públicas dirigidas al desarrollo económico regional que pueden entrar en conflicto con iniciativas de conservación socioambiental, como la construcción de plantas hidroeléctricas, obras de infraestructura importantes o la urbanización no planificada de las ciudades amazónicas.
En este contexto, la FVA creó el programa «Geopolítica de la conservación», que tiene la misión de generar, sistematizar y poner a disposición conocimiento relevante que puede influir en las políticas públicas y apoyar los procesos de toma de decisión relacionados con la gestión territorial en la Amazonía, especialmente a escala de cuencas hidrográficas, unidades de conservación, municipios y otros territorios oficialmente reconocidos, como el Mosaico do Bajo Río Negro y la Región Metropolitana de Manaus (RMM).
- Investigación en las áreas de biología, geografía, geoprocesamiento, entre otros, para apoyar la gestión territorial a diferentes escalas;
- Desarrollo de sistemas de monitoreo e información geográfica para apoyar los procesos de toma de decisión (SiMUR y Sistema de Riesgos);
- Estudios socioambientales para apoyar políticas públicas y proyectos de desarrollo sostenible;
- Articulación y fortalecimiento de redes, comités y consejos de participación de organizaciones de la sociedad civil relevantes para la gestión territorial amazónica (mosaicos de áreas protegidas, comités de cuenca hidrográfica, consejos ambientales estatales y municipales, consejos de unidades de conservación, etc.);
- Capacitación y soporte técnico a gerentes públicos.